Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb7P26011 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms