Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm2788-206ENSMUST00000210463 1338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms