Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HdcP23738 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HdcP23738 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HdcP23738 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HdcP23738 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HdcP23738 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HdcP23738 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HdcP23738 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HdcP23738 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HdcP23738 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HdcP23738 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HdcP23738 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HdcP23738 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms