Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms