Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ggta1P23336 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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