Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms