Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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