Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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