Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtsdP18242 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms