Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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