Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ass1P16460 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms