Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FosbP13346 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FosbP13346 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FosbP13346 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms