Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcp1P11983 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms