Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms