Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms