Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AfpP02772 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AfpP02772 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AfpP02772 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AfpP02772 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AfpP02772 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AfpP02772 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AfpP02772 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AfpP02772 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms