Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms