Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01823 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01823 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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