Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01741 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01741 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01741 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms