Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01669 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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P01669 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01669 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01669 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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P01669 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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P01669 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01669 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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P01669 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01669 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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