Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sp1O89090 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sp1O89090 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sp1O89090 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sp1O89090 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sp1O89090 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp1O89090 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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