Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn1O88704 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Hcn1O88704 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hcn1O88704 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn1O88704 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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