Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dnmt3bO88509 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dnmt3bO88509 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dnmt3bO88509 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnmt3bO88509 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnmt3bO88509 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms