Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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