Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx7O70439 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms