Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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