Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgceO70258 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgceO70258 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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