Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms