Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3aO70157 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top3aO70157 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top3aO70157 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top3aO70157 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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