Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3O54890 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms