Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjd2O54851 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms