Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffbO54788 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffbO54788 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffbO54788 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffbO54788 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffbO54788 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffbO54788 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DffbO54788 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DffbO54788 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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