Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CrxO54751 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CrxO54751 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CrxO54751 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms