Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms