Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl25O35903 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccl25O35903 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl25O35903 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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