Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf9O35739 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms