Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf18O35714 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf18O35714 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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