Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Enc1O35709 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Enc1O35709 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Enc1O35709 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Enc1O35709 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms