Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Slc1a6O35544 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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