Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KeraO35367 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KeraO35367 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KeraO35367 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KeraO35367 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KeraO35367 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KeraO35367 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KeraO35367 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms