Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2O35245 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms