Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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