Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nedd9O35177 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nedd9O35177 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nedd9O35177 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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