Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra3O35118 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra3O35118 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra3O35118 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra3O35118 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra3O35118 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra3O35118 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra3O35118 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra3O35118 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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