Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ArxO35085 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ArxO35085 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms