Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casq1O09165 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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