Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MttpO08601 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MttpO08601 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MttpO08601 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MttpO08601 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MttpO08601 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MttpO08601 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MttpO08601 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms