Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3278L7N2D2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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