Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Vmn2r88L7N1W8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r88L7N1W8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Vmn2r88L7N1W8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Vmn2r88L7N1W8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Vmn2r88L7N1W8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn2r88L7N1W8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn2r88L7N1W8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r88L7N1W8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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