Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms